Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TULP3O75386 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TULP3O75386 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TULP3O75386 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TULP3O75386 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP3O75386 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP3O75386 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP3O75386 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP3O75386 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TULP3O75386 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TULP3O75386 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TULP3O75386 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms