Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL4O60488 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL4O60488 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL4O60488 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms