Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLIN1O60240 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLIN1O60240 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms