Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VEGFDO43915 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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VEGFDO43915 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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VEGFDO43915 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VEGFDO43915 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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