Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HTATSF1O43719 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1O43719 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms