Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN4O43707 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN4O43707 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms