Protein–RNA interactions for Protein: O43555

GNRH2, Progonadoliberin-2, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNRH2O43555 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GNRH2O43555 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNRH2O43555 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms