Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF3O43395 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF3O43395 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms