Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPAA1O43292 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPAA1O43292 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GPAA1O43292 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms