Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SIPA1L1O43166 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIPA1L1O43166 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIPA1L1O43166 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms