Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM2O43147 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM2O43147 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms