Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EPHB6O15197 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EPHB6O15197 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms