Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CITO14578 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CITO14578 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CITO14578 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CITO14578 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CITO14578 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CITO14578 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CITO14578 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CITO14578 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CITO14578 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CITO14578 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CITO14578 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CITO14578 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CITO14578 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms