Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAFD1O14545 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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