Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POLRMTO00411 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLRMTO00411 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLRMTO00411 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms