Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD12O00232 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD12O00232 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD12O00232 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD12O00232 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD12O00232 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD12O00232 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD12O00232 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD12O00232 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD12O00232 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD12O00232 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD12O00232 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD12O00232 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD12O00232 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD12O00232 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD12O00232 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD12O00232 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD12O00232 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms