Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
I3L3M4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
I3L3M4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
I3L3M4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
I3L3M4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
I3L3M4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
I3L3M4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
I3L3M4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
I3L3M4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
I3L3M4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms