Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BQV1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BQV1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BQV1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQV1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQV1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQV1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BQV1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BQV1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BQV1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BQV1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQV1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQV1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQV1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQV1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BQV1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BQV1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
H3BQV1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms