Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
F8VWA3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8VWA3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8VWA3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8VWA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8VWA3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8VWA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8VWA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8VWA3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8VWA3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8VWA3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8VWA3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms