Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PMD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PMD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PMD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PMD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PMD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PMD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PMD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E9PMD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
E9PMD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E9PMD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E9PMD0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
E9PMD0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms