Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MCRIP1C9JLW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MCRIP1C9JLW8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms