Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GOLGA8JA6NMD2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GOLGA8JA6NMD2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8JA6NMD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8JA6NMD2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GOLGA8JA6NMD2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms