Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDR42E2A6NKP2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDR42E2A6NKP2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms