Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
USP17L4A6NCW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP17L4A6NCW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP17L4A6NCW7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms