Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LCHNA4D1U4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LCHNA4D1U4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms