Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ADCY4-201ENST00000310677 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GLOD4-201ENST00000301328 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PDE6B-201ENST00000255622 3280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 N4BP2L1-202ENST00000380130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC004584.3-201ENST00000572877 2356 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NLRP12-203ENST00000391772 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MUC21-202ENST00000486149 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 KBTBD4-209ENST00000533290 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NADK-204ENST00000378625 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SLC6A2-203ENST00000414754 3201 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SCN4B-201ENST00000324727 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DHX35-202ENST00000373323 2347 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF781-203ENST00000590008 2148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBAL3-202ENST00000479328 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LOX-201ENST00000231004 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCF21-201ENST00000237316 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SALL4P1-201ENST00000510352 1860 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FGD5P1-201ENST00000611158 3374 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TUBD1-205ENST00000394239 1680 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GNG12-AS1-203ENST00000420587 2232 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FLNB-203ENST00000419752 2002 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RNF144A-AS1-201ENST00000418970 2374 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC100793.3-201ENST00000592440 719 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL157838.1-201ENST00000424252 2502 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC055717.1-201ENST00000502221 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL356273.3-201ENST00000623474 1989 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ACSL1-204ENST00000504342 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM55A-201ENST00000285419 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC097637.1-201ENST00000494383 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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