Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ESM1-202ENST00000381405 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CATSPERG-202ENST00000409235 3746 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 EEF1AKMT3-202ENST00000333012 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SPIN3-223ENST00000639525 3958 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ACTR1A-205ENST00000487599 2726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CLEC17A-203ENST00000547437 2065 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ANKRD62-202ENST00000587848 2919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MAGEB3-201ENST00000361644 2305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CD83-202ENST00000612003 2307 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC106865.1-202ENST00000507055 2292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TEX13D-201ENST00000632372 4203 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MFSD6-202ENST00000392328 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM69-201ENST00000372025 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NLRX1-203ENST00000409265 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UBE2D3-209ENST00000394804 4166 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC022596.2-201ENST00000635352 3078 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SLC25A6P3-201ENST00000424829 879 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CD300LF-201ENST00000301573 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 BHLHB9-203ENST00000447531 4031 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CSPG4P4Y-201ENST00000333235 3724 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CSPG4P3Y-201ENST00000418188 3724 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 RIC3-201ENST00000309737 2859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PCNX4-204ENST00000406949 3513 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 ZNF221-204ENST00000592350 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 AC092335.1-201ENST00000509037 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LSAMPQ13449 FAM124B-203ENST00000409685 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms