Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MAD1L1Q9Y6D9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAD1L1Q9Y6D9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms