Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARFGEF1Q9Y6D6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF1Q9Y6D6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms