Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HDGFL3Q9Y3E1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms