Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
THRAP3Q9Y2W1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
THRAP3Q9Y2W1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms