Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NUDCQ9Y266 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUDCQ9Y266 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms