Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDAC5Q9UQL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HDAC5Q9UQL6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms