Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCN8AQ9UQD0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCN8AQ9UQD0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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