Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGTPBP1Q9UPW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms