Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGAP1Q9UPQ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms