Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH9Q9ULB4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms