Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNMA2Q9UL42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNMA2Q9UL42 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA2Q9UL42 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms