Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMFRQ9UKV5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms