Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SALL4Q9UJQ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SALL4Q9UJQ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SALL4Q9UJQ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms