Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NPC1L1Q9UHC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NPC1L1Q9UHC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NPC1L1Q9UHC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms