Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRRDQ9UH36 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRRDQ9UH36 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms