Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF20Q9UGU0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF20Q9UGU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms