Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNOT8Q9UFF9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNOT8Q9UFF9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms