Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHPF2Q9P2E5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHPF2Q9P2E5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHPF2Q9P2E5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms