Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTN3Q9P232 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN3Q9P232 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms