Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYOFQ9NZM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYOFQ9NZM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms