Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBP1Q9NZI7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBP1Q9NZI7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms