Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNIP1Q9NZI2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNIP1Q9NZI2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms