Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.54■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C9orf78Q9NZ63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C9orf78Q9NZ63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms